Doğadaki biyolojik dengenin kurulması ve korunması için birçok bakteri türü gibi kemosentetik bakterilerin de önemli rolleri bulunmaktadır. Bu bakteriler, atık maddelerin parçalanmasını ve tekrar kullanılabilir hale sağlayarak çevre kirliliğini de önlemiş olmaktadır. Ayrıca kemosentetik bakteriler azot gibi bazı elementlerin doğada devirli olarak kullanılmasında görev yamaktadır.
